Подкласс ящерохвостых птиц включает один отряд с единственным семейством Archaeopterygidae и двумя родами: Archaeopteryx (два отпечатка) и Archaeornis (один отпечаток).
Сейчас большинство исследователей полагает, что все отпечатки относятся к одному виду Archaeopteryx lithographica М. Отличия между изученными экземплярами объясняют половой и возрастной изменчивостью.