Если географические изоляты выработали достаточно четкие морфологические, поведенческие или другие отличия и продолжают жить в изоляции, не контактируя с популяциями исходного вида, их обычно рассматривают как близкие, но самостоятельные виды с аллопатрическим распространением. В качестве примера можно привести тихоокеанскую ипатку Fratercula corniculata и атлантического тупика Fratercula arctica. При меньшей степени морфологического разобщения таксономическое положение подобных форм может быть спорным: часть систематиков рассматривает их как самостоятельные аллопатрические виды, а другие - как подвиды политипического вида (примеры приведены ниже).
Однако изоляты могут вновь восстанавливать контакт с основной частью популяций вида. Если ко времени восстановления контакта изолят резко не обособился от исходных популяций, то возникающая зона контактов (зона вторичной интерградации) выражена как обычная зона контактов между подвидами. Если же у изолята до вторичного контактирования выработались резкие различия (чаще морфологические), но не возникли механизмы репродуктивной изоляции, то зона вторичной интерградации обычно выражена достаточно резко. Примером такого рода, вероятно, могут быть уже упоминавшиеся зоны контакта серых и черных ворон (рис. 3).В подобных случаях некоторые систематики рассматривают вторично контактирующие формы как самостоятельные виды (хотя еще не окончательно обособившиеся), другие - как резко различающиеся подвиды, так как здесь отсутствует основной критерий вида - репродуктивная изоляция.
Таких спорных случаев в орнитологической таксономии довольно много; в нашей фауне их около 50. Если эти формы рассматриваются как самостоятельные виды, то подвидовое название второй формы становится ее видовым названием. Сопоставляемые формы могут входить в политипический вид с большим числом подвидов. Если указанным формам присваивается ранг самостоятельного вида, то тем самым исходный политипический вид разделяется на два (или больше) вида, а все остальные подвиды исходного политипического вида распределяются между вновь принятыми видами. Такое спорное положение занимают атлантическая Gavia arctica arctica L. и тихоокеанская G. arctica pacifica Lawrence чернозобые гагары, темноклювая Gavia immer immer Brunn и светлоклювая G. immer adamsii Gray полярные гагары, азиатский Accipiter badius badius Gmelin и европейский A. badius brevipes Severtzov тювики, сапсан Falco peregrinus peregrinus Tunstall и пустынный сокол F. peregrinus pelegrinoides Temminck, европейский Falco vespertinus vespertinus L. и амурский F. vespertinus amurensis Radde кобчики, обыкновенный Alectoris graeca graeca Meisner и гималайский A. graeca chukar Gray кеклики, обыкновенный Coturnix coturnix coturnix L. и японский С. coturnix japonica Temminck et Schlegel перепела, зуек-галстучник Charadrius hiaticula hiaticula L., уссурийский зуек Ch. hiaticula placidus Gray и перепончатопалый галстучник Ch. hiaticula sem palmatus Bonaparte, каспийский Charadrius asiaticus asiaticus Pallas и монгольский Ch. asiaticus veredus Gould длинноногие зуйки, американский Tringa (Heteroscelus) incana, incana Gmelin и сибирский Т. (Н), incana brevipes Vieillot пепельные улиты, эскимосский Numenius borealis borealis Forster и сибирский N. borealis minutus Gould кроншнепы малютки, атлантический Cepphus grylle grylle L. и тихоокеанский С. grylle columba Pallas чистики, южный Ketupa zeylonensis zeylonensis Gmelin и северный К. zeylonensis blakistoni Seebohm рыбные филины, обыкновенный Calandrella pispoletta (rufescens) pispoletta Pallas и манчжурский С. pispoletta cheleensis Swinhoe серые жаворонки, обыкновенный Corvus corax corax L. и пустынный С. corax ruficollis Lesson вороны, черная Corvus corone corone L. и серая С. corone comix L., обыкновенные вороны, обыкновенная Corvus monedula monedula L. и даурская С. monedula dauricus Pallas галки, европейская Acrocephalus a. arundinaceus L. и малоазиатская A. arundinaceus stentoreus Hemprich et Ehrenberg дроздовидные камышевки, европейская Sylvia curruca curruca L., кашгарская S. curruca minula Hume и горная S. curruca althea Hume славки завирушки, японская Muscicapa narcissina narcissina Temminck и даурская M. narcissina zanthopygia Hay желтоспинные мухоловки, чернопегая каменка Oenanthe hispanica hispanica L. и каменка плешанка О. hispanica pleschanka Lepechin, западная Oenanthe lugens lugens Lichtenstein и восточная О. lugens finschi Heuglin черношейные каменки, бледный Turdus pallidus pallidus Gmelin, японский Т. pallidas chrysolaus Temminck и оливковый Т. pallidus obscurus Gmelin дрозды, рыжий Turdus naumanni naumanni Temminck и темный Т. naumanni eunomus Temminck дрозды Науманна, американская Parus atricapillus atricapillus L., европейско-азиатская P. atricapillus montanus Baldenstein и тяньшанская P. atricapillus songarus Severtzov буроголовые гаички, белая Parus суanus cyanus Pallas и желтогрудая P. cyanus flavipectus Severtzov лазоревки, обыкновенная Parus major major L., бухарская P. major bokharensis Lichtenstein и японская P. major minor Temminck et Schlegel большие синицы, американский Sitta canadensis canadensis L., малоазиатский S. canadensis kr üperi Pelzeln и китайский S. canadensis villosa Verreaux черноголовые поползни, домовый (городской) Passer domesticus domesticus L. и индийский P. domesticus indicus Jardine et Selby воробьи, европейский Montifringilla nivalis nivalis L. и азиатский M. nivalis alpicola Pallas снежные вьюрки, обыкновенный Carduelis carduelis carduelis L. и седоголовый С. carduelis caniceps Vigors щеглы, обыкновенная Acanthias (Carduelis) flammea flammea L. и толстоклювая (тундряная) A. flammea hornemanni Holboll чечетки, малая Erythrina (Caprodacus) rhodochlamys rhodochlamys Brandt и большая E. (С.) rhodochlamys grandis Blyth. розовые (арчевые) чечевицы, обыкновенный Pyrrhula pyrrhula purrhula L. и серый P. purrhula cinereacea Cabanis снегири.