Ареал обычного политипического вида включает ареалы составляющих его более или менее различающихся популяций, которые группируются в подвиды или образуют клину. Между отдельными популяциями идет обмен генами. Но иногда популяции или группа популяций оказываются изолированными от остальной массы популяций своего вида внешними преградами, препятствующими или сильно затрудняющими обмен генов между ними. Такие популяции называют географическими изолятами. Географические изоляты возникают там, где экологические или географические условия определяют островное (пятнистое) распределение популяций данного вида. Особенно часто они встречаются на удаленных от материка островах и на периферии ареала. Могут образовываться географические изоляты и в результате изменения внешних условий (изменения растительности из-за повышения сухости климата, оледенения и т. д.) и при расселении отдельных популяций за пределы основного обитания вида.
Образование изолятов зависит не только от внешних условий, но и от характера изменчивости вида, способности его к расселению. Поэтому некоторые виды на обширных, зачастую достаточно резко изолированных или разобщенных территориях могут быть фенотипически однообразными, тогда как другие виды в сходных условиях образуют изоляты, вырабатывающие более или менее четкие морфологические, экологические, физиологические и другие отличия от остальных популяций своего вида. Скорость и степень обособления изолятов может варьировать в широких пределах; достаточно четко обособленные изоляты птиц на островах между Калимантаном и Сулавеси, видимо, имеют возраст менее 10 000 лет, подвиды птиц Евразии и Северной Америки, возникшие в периоды развития оледенения, значительно старше.
Судьба географических изолятов может быть различной (Майр, 1968). Они могут: 1) превратиться в самостоятельные виды, 2) существовать в изоляции длительное время, 3) восстановить контакт с основной частью популяций своего вида, образовав вторичную зону контакта, 4) полностью вымереть. Таксономический статус и степень фенотипических отличий изолятов обусловливаются длительностью изоляции, способностью изолированной популяции к изменчивости, характером факторов внешней среды в зоне изоляции и т. п. Одни изоляты фенотипически совершенно похожи на основную часть видовых популяций, другие отличаются столь резко, что многие исследователи рассматривают их, как самостоятельные виды, отличия третьих находятся на грани между видовыми и подвидовыми признаками и т. д. В ряде подобных случаев таксономическое положение изолятов оказывается спорным и вызывает резкие разногласия.