Географическая изменчивость может проявляться не ступенчато, как в описанных выше случаях, а очень постепенно. При этом изучаемые таксономические признаки изменяются плавно и постепенно на значительном протяжении ареала вида; переходы между отдельными популяциями не улавливаются. Такая географическая изменчивость называется клинальной, а градиент изменчивости отдельных признаков - клиной (этот термин впервые ввел Д. Гексли, 1939). Клинальная изменчивость, видимо, может быть вызвана комплексом факторов. В ряде случаев постепенно изменяются факторы среды (например, климат). Потоки генов между близкими популяциями имеют тенденцию сглаживать межпопуляционные различия. Может быть, здесь сказывается эффект морфогенетического гомеостаза, скрывающего генные различия между популяциями, особенно при активном обмене генами между ними. Майр (1968) характеризует клинальную изменчивость как результат взаимодействия двух противоречивых сил: отбора, стремящегося приспособить каждую популяцию к ее локальной среде, и потока генов, направленного на сохранение сходства всех популяций вида.
До сих пор клинальная изменчивость у птиц изучена очень мало, хотя она, видимо, достаточно широко распространена. Клинальная изменчивость отдельных признаков описана у ряда видов птиц семейства дронговых Dicruridae, у райской птицы Paradisaea apoda и немногих других видов. С запада на восток клинально изменяются размеры и пропорции клюва белолобого гуся Anser albifrons и гуменника Anser fabalis. Видимо, более или менее клинально изменяется окраска и пропорции у сорокопута жулана Lanius colurio (cristatus). Выявление и исследование случаев клинальной изменчивости - одна из насущных задач систематики.